En una batidora con el aditamento de globo, bate las claras a velocidad media-alta de 4 a 5 minutos, hasta que se formen ondas suaves. Baja la velocidad a media y añade el azúcar poco a poco, batiendo las claras hasta que se formen ondas más duras y brillantes. Pasa las claras a un recipiente grande y aparta.
Vierte las yemas a otro recipiente grande y bate con un globo para batir o tenedor, hasta que estén esponjosas y de color amarillo pálido. Añade la vainilla y sigue batiendo hasta incorporar todo. Incorpora con cuidado la mezcla de yemas a la mezcla de claras con una espátula de hule, para no desinflar las claras. Incorpora la harina 1/4 de taza a la vez y revuelve bien.
En un recipiente pequeño, mezcla el agua caliente con la cocoa en polvo. Vierte la mitad de la masa en otro recipiente e incorpora la cocoa con una espátula hasta que estén totalmente mezclados.
Extiende la masa de vainilla en el molde engrasado. Vierte la masa de chocolate encima, en línea recta hacia el centro. Con un cuchillo o cuchara, haz un diseño de remolino desde un lado del molde al otro. Hornea de 22 a 25 minutos, hasta que la superficie del pastel este ligeramente dorada y se sienta esponjosa al tacto. Saca el pastel del horno y deja que se enfríe.
Usando un tenedor, haz hoyos por toda la superficie del pastel, para que absorba la salsa de tres leches.